通常而言，若是ERP管理系统只应用于某个部门只会推动该部门工作的顺利开展，例如该系统只应用在财务部门，只能实现财务管理规范化、改善应收账款和资金管理；仅在生产部门应用只能辅助制定生产计划和物资需求计划，仅在销售部门应用，只能加强和改善营销管理；仅在库存管理部门应用，只能帮助掌握存货信息。只有在企业内大范围集成ERP系统，并运行起来，才有可能达到降低库存，提高资金利用率和控制经营风险；缩短产品生产周期，控制生产成本；减少财务坏账、呆账金额等目标。另外这些目标的达成，还要取决于企业业务流程重组再造的效果。一个ERP系统是对企业物流、资金流、信息流进行一体化管理的软件系统，其核心管理思想就是实现对“供应链”的管理。软件的应用将跨越多个部门甚至多个企业。为了达到预期设定的应用目标，最基本的要求是系统能够运行起来，实现集成化应用，建立企业决策完善的数据体系和信息共享机制。这种集成的系统意味着数据一旦进入系统，就能够在系统各个部分使用，减少了传统业务中的多次数据录入。这样势必会改变传统业务的工作流程，也就是说ERP系统的使用一般意味着业务流程的再造。

ERP系统的应用使得企业内部信息共享程度提高、团队工作协调性提升，加强企业的组织结构的扁平化管理。国外学者的研究表明ERP系统在企业中大量采用会使得企业财务人员和管理人员数量降低，企业管理效率提升。ERP系统的应用使管理者们能够及时得到企业作业多元化信息，将更多的精力投入企业的远期构想和决策中。